Uning molekulasida N-S bog'lar mavjud bo'lganligi sababli, Kathon bakteritsid ta'sirini bakterial va suv o'tlari oqsillaridagi bog'larni buzish orqali amalga oshiradi. Mikroorganizmlar bilan aloqa qilganda, ularning o'sishini tezda inhibe qiladi; bu inhibisyon jarayoni qaytarilmas bo'lib, mikrob hujayralarining o'limiga olib keladi. Hujayra o'limidan oldin, Kathon bilan davolash qilingan mikroorganizmlar endi fermentlarni sintez qila olmaydi yoki yopishtiruvchi biofilm moddalarini ajrata olmaydi. Sovuq suv tizimi uskunasi yuzasiga yopishgan biofilmga kirib, Kathon biofilm ostidagi mikroorganizmlarni samarali boshqaradi.
Izotiazolinon hosilasi sifatida Kathonning turli bakteriyalar bilan o'zaro ta'siri keng o'rganilgan. Geterotsiklik birikma sifatida uning bakteritsid mexanizmi asosan oksidlovchi emas, u bakterial oqsillardagi DNK asoslari bilan vodorod aloqalarini hosil qilish uchun geterotsiklning faol qismiga tayanib, bakterial hujayraga adsorbsiyalanadi va shu tariqa DNK tuzilishini buzadi, uni hujayraning o'limiga olib kelmaydi.
